芗城区持续加大医疗卫生事业的投入。2019年以来，共投入8.35亿元，全面实施卫生健康补短板三年行动计划，推进区妇幼保健院、区公共卫生应急处置中心、人民医院门诊综合楼及11家基层医疗机构等一批项目建设，市人民医院医技楼、“三大平台、六大中心”、63家公办村卫生所等项目建成投用，基层中医馆实现全覆盖。2022年，将实现全区医疗业务用房100%达标建设；强化人才引进培养，千人均执业（助理）医师数达到2.98人，超额完成市“十三五”规划目标。全区床位、人才等资源大幅扩充，2020年全区床位总数、卫技人员总数分别为2540张和4136人。